丹尼尔米. Stoebel

丹Stoebel

生物学教授

F.W. 奥林科学中心2364室
1250 N. 达特茅斯大街.
Claremont, CA 91711
909.607.1141
stoebel@g.172ty.com

教育及专业经历

  • B.A.波莫纳学院生物学专业
  • 石溪大学生态学和进化博士
  • 都柏林大学圣三一学院博士后研究员
  • 美国休斯敦大学博士后研究员

教学的兴趣

我的教学兴趣包括分子和进化遗传学, 从一年级到高年级, 在实验室, 研讨会, 讲座设置. 我也非常喜欢教授统计学和生物与人文学科的交叉课程.

在过去的几年里，我教过：

  • 生物52：生物导论
  • 生物54：生物入门实验
  • 生物113：分子遗传学
  • 生物统计学
  • 生物164：遗传学
  • 生物/化学189：分子生物学和生物化学的当前主题
  • 历史179J：遗传与种族
  • 写作1：学术写作导论

研究兴趣

我的实验室主要研究细菌调控网络的分子生物学和进化. 的 E. 杆菌 全球转录调控因子RpoS是研究的重点, 因为它允许分子生物学的整合, 生理与进化. 项目包括研究RpoS水平如何在不同菌株和环境中变化, 测量RpoS水平变化对转录组的影响, 研究RpoS如何与其他转录因子相互作用以影响转录模式, 探索RpoS水平在实验室致病亲属中的调控变化 E. 杆菌.

我鼓励HMC或其他克莱蒙特学院的学生联系我，如果他们对此感兴趣的话. 我经常邀请各种背景的学生来我的实验室.

选定的出版物

（*表示本科期间完成的工作）

Adams, Josephine*, Johnson Hoang*, Emily Petroni*, Ethan Ashby*， Johanna Hardin和 丹尼尔米. Stoebel. “rpos依赖基因的转录时间在多种胁迫下发生变化 大肠杆菌 K-12.” mSystems, 8: e0066323. http://doi.org/10.1128/msystems.00663-23

贝克，克里斯蒂娜*，塞德·佩里*， 丹尼尔米. Stoebel和简·M. 刘. “Cra和CRP在FruB的调节中具有相反的作用 霍乱弧菌.” 细菌学杂志, 203:e00044-21. http://doi.org/10.1128/JB.00044-21

史蒂芬·菲茨杰拉德，史蒂芬尼·C. 凯里，埃布蒂哈尔. Keith D . Alshabib. 麦肯齐, 丹尼尔米. Stoebel，赵子超，张德华. S. 卡梅隆. “重新定义H-NS蛋白家族：多种特殊的核心和附属形式表现出分层转录网络整合.” 2020. 核酸研究 48: 10184–98. http://doi.org/10.1093/nar/gkaa709

汉密尔顿，费雯，还有 丹尼尔. M. Stoebel. 2020. 科学家教育的历史：鼓励判断和社会行动. 伊西斯 111: 623–30. http://doi.org/10.1086/711101

布什,E. C., A. E. 克拉克* C. A. DeRanek *,. Eng *, J. 福尔曼* K. 希斯*,. B. 李*, D. M. Stoebel, Z. 王*,米. 威尔伯*和H. Wu*. 2018. xenoGI：在密切相关的细菌分支中重建基因组岛插入的历史. BMC生物信息学, 19:32. doi: 10.1101/188599

G. T. 黄* R. P. Bonocora,. N. Schep *,年代. M. 分为上下*,. J. 李方，L. M. Shull * L. E. Batachari *,米. 狄龙* C. J. 贝克尔* C. 埃文斯* E. C. 布什,J. 哈丁,J. T. 韦德, D. M. Stoebel. 2017. 不同RpoS水平的全基因组转录反应 大肠杆菌 K-12. 细菌学杂志, 199: e00755-16. doi: 10.1128/JB.00755-16.

C. 埃文斯*,J. 哈丁, D. M. Stoebel. 2017. 从样本间RNA-Seq归一化方法的假设角度进行选择. 生物信息学简介. doi: 10.1093 /龙头/ bbx008.

Y. 王,C. D. 领域, D. M. Stoebel, K. 弗林,E. 纳普米. M. 狄龙,. 希望,P. J. 孵卵器,F. B.-G. 摩尔,V. S. 库珀和T. F. 库珀. 2016. 转移突变的好处可以通过接受者的适应性来预测，而不是通过他们的生态或遗传相关性来预测. PNAS, 113:5047-5052.

E. 斯奈德* D. M. 戈登, D. M. Stoebel. 2012. 大肠杆菌 缺乏RpoS在非病原体的自然种群中是罕见的. G3：基因|基因组 | 遗传学, 2:1341-4

Stoebel D. M. & C. J. 多尔曼. 2010. 移动元素的作用是10 论实验调控演化 大肠杆菌. 分子生物学与进化, 27: 2105-2112.

Stoebel D. M., K. Hokamp, M. S. 最后的 & C. J. 多尔曼. 2009. 基因调控在应激反应中的代偿进化 E. 杆菌 缺乏rpo. 公共科学图书馆遗传学 5: e1000671

Stoebel D. M., A. 免费的 & C. J. 多尔曼. 2008. 抗沉默：克服革兰氏阴性肠道细菌中h - ns介导的转录抑制. 微生物学, 154: 2533-2545.

Stoebel D. M., A. M. 迪安 & D. E. Dykhuizen. 2008. 的表达成本 大肠杆菌 虫胶 操纵子蛋白存在于过程中，而不是产物中. 遗传学, 178:1653-1660.

Stoebel D. M. 2005. 缺乏水平转移的证据 虫胶 操纵子进 大肠杆菌. 分子生物学与进化, 22:683-690.